ESCMicroRNA作为

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编译:医院谢冰歆刘彤

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背景/INTRODUCTION

在癌症患者的尸检中,1%到20%患者可见心包恶性受累。最常见累及心包的转移瘤是肺癌。该研究的目的是根据外周血浆中miRNA的表达来鉴别心包积液的起源(即心包炎VS癌症)。

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方法/METHODS

8名患者因肿瘤源性心包积液住院(肺癌)。对照组是8例炎性心包渗出患者。使用mirVanaPriskit提取血浆RNA,荧光法测定RNA质量。GEP分析使用ClariomDpico芯片并在Affymetrix平台上进行分析。使用TAC软件进行统计分析。使用从TAC输出获得的信号信息,应用R语言软件中进行进一步分析。使用log2转换数据和所有对照组(A-F)进行了以下测试。根据变量的不同,采用额外的FDR校正、logistics回归、Mann-whitneyt检验。使用R语言ROC软件包计算了曲线下的面积。评分范围为0-1。使用Spearman相关性(截止值=0.9,Rpval=0.05)进行共表达分析以确定真正表达的基因。为了确定DEmiRNA的靶点,使用wizbionetR语言软件包。

使用multimiR软件包进行靶标筛选,从所有可用数据库中选择前20%的预测因子。

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结果/RESULTS

本研究分析了所有成熟的靶点,如果DE-miR被确定为pre-miR,就为其生成-3p和5p版本。研究还筛选了DisgeNet数据库中与癌症和心包炎相关的基因,确定了和个此类基因。在确定DEmiRNA的靶点后,研究人员进行了数据汇总、总结,并获得了每个DEmiRNA调控的总靶点数量和与IS相关的靶点数量的信息。

此外,研究人员还确定了由表达差异最大的miRNA调控的最多的靶点。与心包炎患者相比,恶性肿瘤患者血浆中MiR-、MiR--5p、MiR-、MiR-和MiR-的表达差异最大。与心包炎相比,恶性肿瘤患者心包液中MiR-22-3p、MiR-a、MiR-、MiR--3p和MiR--5p的表达差异最大。

重要的是,本研究发现miR-b、miR-、miR-、miR-24-3p、miR--3p是鉴别恶性肿瘤和炎症相关心包积液最有可能的生物标志物。

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结论/CONCLUSION

本研究结果首次表明,基于对心包积液患者外周血和心包液miRNA的比较,miRNA对不同病因导致心包积液具有不同的诊断能力。

CEyileten1,ZWicik1,DJakubik1,JJarosz-Popek1,PCzajka1,MJezewski1,MWolska1,AFitas1,ANowak1,AGasecka2,SDeRosa3,MPostula1

1MedicalUniversityofWarsaw,CenterforPreclinicalResearchandTechnologyCEPT,DepartmentofExperimentalandClinicalPharma-Warsaw-Poland

2MedicalUniversityofWarsaw,1stChairandDepartmentofCardiology-Warsaw-Poland

3MagnaGraeciaUniversityofCatanzaro,DivisionofCardiology,DepartmentofMedicalandSurgicalSciences-Catanzaro-Italy

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