引起鸡群肿头肿眼的疾病主要为支原体、流感、大肠杆菌和传染性鼻炎等。接下来逐一为你分析：
1、支原体
临床症状及剖检：感染后鸡群出现咳嗽、甩鼻情况，个别鸡只会出现一侧或两侧眼睛红肿、流泪，眼睛内有泡沫样的液体。
2、流感
在秋冬两个季节最易发生，发病快，死亡率高，同病毒的毒力有很大的关系。
各品种各日龄的鸡群都易感染，主要通过空气、水、饲料等进行水平传播。
临床症状及剖检：鸡群发病初期最为明显的就是呼吸道症状，咳嗽、啰音、伸脖张口，头部眼睑水肿，排黄白绿色粪便。采食下降，饮水增加，产蛋鸡群产蛋下降或停产，蛋的品质下降出现沙皮蛋、软壳蛋、小蛋等。
解剖腺胃、肌胃出血、肠道出血，肠道粘膜上有不规则的出血斑，呼吸道粘膜出血、充血;心冠脂肪出血，心肌出血，胰腺边缘出血，肾脏肿胀出血，并有尿酸盐沉积，产蛋鸡卵泡变形、变性、出血或充血;输卵管粘膜肿胀，内有变色脓性分泌物。
3、传染性鼻炎
发生在秋冬季节，在商品蛋鸡发病最常见，易引起鸡群采食下降，生产性能下降，本病最易反复发生。
临床症状及剖检：鸡群感染初期流薄的鼻液，逐渐浓稠，有臭味，干燥后形成黄色结痂。引起鸡群打喷嚏、甩头、鼻子出现粘料，眼结膜发炎，流泪，眼睑周围肿胀，剖检鼻腔，鼻腔和鼻窦内粘膜有出血或充血，并且有大量的粘液及干酪样物。
4、大肠杆菌
大肠杆菌是条件性致病菌，对一些抗生素药物易产生耐药性;当鸡群受到应激时最易发生，如天气骤变，疫苗免疫、鸡舍通风不良等，一旦诱发而且不易控制。
临床症状及剖检：感染的鸡只发生眼结膜肿胀，流泪，严重的出现脓性或干酪样分泌物，长时间发生会出现心包炎、肝周炎、卵黄性的腹膜炎。
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